城市湿地处于城市生态系统与自然生态系统的过渡地带，区域范围内及其周边的人类生产、生活活动密集。城市化过程中如何协同湿地保护修复已成为城市绿色发展的一个重要议题。

城市湿地保护最大的困难在于，在快速城市化的大背景下，湿地一方面要满足城市化建设的需要，另一方面又需要合理保护并为城市提供持续充足的生态服务。

但城市化进程不可避免地会占用大量的湿地，并产生湿地格局破碎化、水体污染等水生态水环境问题。同时，城市湿地保护修复目标的不确定性及其顶层设计不足，也导致对于湿地的保护成效有限。

城市湿地既包括人为扰动较少，具有较高生物多样性保护价值的郊野自然湿地，也包括生物多样性贫乏，但景观休闲价值突出的城区湿地，以及兼具一定生物多样性和景观娱乐价值的近郊湿地。

在城市化梯度影响下，不同湿地的功能价值差异明显，难以用统一的标准衡量，因此，其保护修复必要性和目标也需要具体分析。

但是当前湿地修复仍主要围绕水质提升、水鸟等代表性物种栖息地质量改善等易于量化评估的目标，而城市湿地特有的环境净化、人居环境改善、城市气候调节和景观文化等方面功能效益尚欠缺考虑。

而湿地功能定位模糊导致城市湿地保护管理与建设目标定位不明确，进一步导致城市湿地保护修复或开发建设工程的多次修改返工，给城市湿地保留的自然生态系统结构和功能带来冲击。

此外，水资源短缺，城市湿地生态用水保障不足、城市湿地保护管理缺乏充分的法律和制度保障、多部门管理机制与湿地生态系统保护的整体性需求不匹配、城市湿地保护管理尚缺乏有效的市场和社会参与机制等也是当前城市湿地保护面临的困境。

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